Le Fuuinjutsu est l'art d'utiliser les sceaux. Seuls les shinobis le splus doué peuvent maitriser ces techniques car elles demandent un niveau de concentration et de contrôle du chakra importante. Le Fuuinjutsu permet de sceller des êtres dans le corps [ Bijuus ], de dévelloper le corps et les capacîtés de quelqu'un [ Marque Maudite ], ou même simplement d'enfermer quelque chose dans une boite protégé d'un Fuuinjutsu.